单细胞抗体测序分析服务

单细胞抗体技术(single B cell antibody technology)是抗体发现的全新技术手段,通量高、漏筛率低,且没有体外筛选抗体不是天然配对的弊端,有着广阔的前景。泓迅科技的单细胞抗体服务,包括B细胞抗体的研发与制备,及B细胞抗体测序和深度分析等。

B细胞,即B淋巴细胞,主要执行机体的体液免疫,在抗原刺激下分泌产生抗体并发挥作用。在适应性免疫应答期间,活化的B细胞扩增并经历其B细胞受体(BCR)的体细胞超突变,形成多样化的细胞克隆。此外,抗体作为复合物分子,其每个重链(VH)和轻链(VL)中存在三个互补决定区(CDR),并且重链的CDR3变化最为丰富,可在V,D和J基因区段之间的连接处形成并且倾向于高水平的超突变。因此,B细胞产生的天然VH / VL抗体对理解抗体生物学和设计至关重要。

泓迅科技基于先进的GenoTM Ab平台,提供专业的单细胞抗体测序分析服务,可帮助研究人员全面评估免疫系统的多样性,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。

服务优势

  • 专有的抗体大数据平台,可对抗体的重链和轻链配对进行打分,筛选最可能的完整抗体序列
  • 独特的内部数据挖掘工具,对抗体测序结果进行预处理,最大程度避免假阳性等测序误差
  • 完备的生物信息学分析,经验丰富的抗体研究团队,深度挖掘高价值信息
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    服务流程

    单细胞抗体测序分析服务1

    泓迅经典案例

    泓迅科技根据客户所提供的抗体测序原始数据,通过生物信息学分析,对细胞VDJ重构、V/J基因频率、V-J成对使用频率、CDR3长度分析、B细胞克隆计数、受体多样性分析、组间多样性差异分析、组间V、J基因差异分析、组间克隆表达CDR3长度分布差异等详细分析,并提供了专业的研究报告。

    结果展示:
    1) VDJ 基因使用频率分析

    Table BCR样本中 V 基因使用频率统计

    Gene_name Reads Frequency
    4-39*01 27980 4.97
    4-34*01 12488 2.22
    1-2*02 5007 0.889
    3-74*01 4798 0.852
    1-18*01 3011 0.535
    3-7*01 2862 0.508
    2-70*13 2313 0.411
    3-74*03 2240 0.398
    1-69*01 1943 0.345
    4-31*03 1583 0.281

    单细胞抗体测序分析服务2

    2) CDR3 区域长度分析

    单细胞抗体测序分析服务3

    3) CDR3种类分析

    BCR测序统计CDR3氨基酸序列长度

    CDR3 Reads Frequency len
    DNNNDMR 3560 0.004869 7
    VISRTL 1688 0.002308 6
    AVDSNYQLI 899 0.001229 9
    AVNRDDKII 718 0.000982 9
    AATDSWGKLQ 696 0.000952 10
    AVTDSWGKLQ 627 0.000857 10
    AVNTGNQFY 595 0.000814 9
    AVTGGGNKLT 573 0.000784 10
    AVPTGTASKLT 562 0.000769 11
    LVGDTGRRALT 540 0.000738 11
    AEITLT 517 0.000707 6

    4) 序列总长排序

    BCR氨基酸序列总长reads数

    氨基酸基因序列长度 氨基酸数目 丰度
    1491 147 0.096324
    20 139 0.044324
    540 143 0.040395
    529 145 0.041238
    516 147 0.041955
    504 143 0.042773
    496 141 0.043976
    441 145 0.040898
    433 145 0.041868
    387 148 0.039055

    5) 不同样本之间的VH基因的频率差异分析

    单细胞抗体测序分析服务4

    6) 样本测序饱和度分析

    单细胞抗体测序分析 单细胞抗体测序分析1

    7) 克隆多样性分析

    克隆多样性分析

    上机类型 Shannon Entropy Inverse Simpson
    BCR 19.7458 340.758

    服务详情

    服务名称 主要内容 分析软件 交付周期 交付项目
    单细胞抗体测序分析服务 测序数据挖掘;
    抗体信息分析等
    R, Python
    Software等
    7~10天 分析报告

    * 如需订购抗体测序服务,请了解相关服务:杂交瘤细胞抗体基因测序抗体组库/免疫组库测序,或详询support@synbio-tech.com

    抗体测序生信分析服务订购

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